СОСТАВ НАБОРАКат. номер | Состав | Объем, мкл | Кат. номер компонента набора производства БелБиолаб (мин. фасовка) |
RK-RFS-100
| Ревертаза RevM (200 Ед/мкл) | 120 | RevM ревертаза E-RT (#E-RT-5B) |
Ингибитор РНКаз (40 Ед/мкл) | 60 | РНАзин Н (#R-RN-0.05) РНАзин M (#R-RNM-10) |
5X реакционный буфер TG+ (содержит 15 мМ MgAc) | 500 | - |
Праймер олиго(dT)18 (100 пмоль/мкл) | 120 | - |
Случайный гексамерный праймер (100 пмоль/мкл) | 120 | - |
Вода без нуклеаз | 5 × 1250 | Высокоочищенная вода 1 типа (#R-W1-50) |
ОПИСАНИЕ ПРОДУКТАНабор для синтеза кДНК RevM представляет собой полную систему для эффективного синтеза первой цепи кДНК из матриц мРНК или тотальной РНК. Он содержит ревертазу RevM — генетически модифицированную обратную транскриптазу, выделенную из вируса лейкоза мышей (M-MuLV), которая отличается от M-MuLV дикого типа по структуре, каталитическим свойствам и температурному оптимуму активности.
Данный фермент характеризуется РНК- и ДНК-зависимой полимеразной активностью, но не проявляет активности РНКазы H. Температурный оптимум для его активности составляет 55 °C (активность сохраняется при температуре до 60 °C включительно). Фермент RevM способен синтезировать кДНК длиной до 10 т.п.н. и включать модифицированные основания.
Ингибитор рекомбинантных РНКаз, входящий в набор, представляет собой рекомбинантный плацентарный белок человека массой 50 кДа, экспрессируемый в Escherichia coli. Он ингибирует активность рибонуклеаз эукариот (РНКазу A, РНКазу B и РНКазу C), что предотвращает распад РНК.
Для хранения образцов РНК рекомендуем буфер для хранения РНК (#, БелБиолаб). Буфер для хранения РНК подходит для хранения мазков/ биопрепаратов, содержащих РНК. Для надежного хранения РНК требуется до трехкратного превышения объема буфера к объему образца. В отличии от консервантов включающих ГТЦ или аналоги пригоден для методов прямой амплификации ДНК/РНК полимеразой blitz (#E-BLP-0.25, БелБиолаб) и One-step direct (#, БелБиолаб).
ПРОТОКОЛ ИСПОЛЬЗОВАНИЯДля приложений ПЦР с детекцией результатов в режиме реального времени матрица РНК не должна содержать загрязнений ДНК. Для удаления следовых количеств ДНК кДНК РНК перед синтезом может обрабатываться ДНКазой I (#?), не содержащей РНКазы. Всегда проводят контрольную реакцию (ОТ-минус), которая включает все компоненты для ОТ-ПЦР, за исключением обратной транскриптазы.
Перед началом анализа важно учесть следующее:
- следует использовать виды пластика, не содержащие РНКаз;
- при работе с РНК и другими реагентами необходимо всегда использовать перчатки, поскольку кожа является источником РНКазы.
- используемые реагенты не должны содержать РНКазы, в том числе высокоочищенная вода;
- необходимо использовать ингибитор РНКаз для защиты от РНКаз;
1. Разморозить все компоненты реакционной смеси и матрицы РНК.
2. Готовить реакционную смесь в соответствии с таблицей 1.
Таблица 1. Состав реакционной смеси (20 мкл)Компонент | Исходная концентрация | Конечная концентрация, мкМ | Объем, мкл |
5X буфер TG+ | 5х | 1× | 4 |
олиго(dT)18; случайный гексамерпраймер (рандом-праймер); ген-специфические праймеры | 100 мкМ* | 2-5 2-5 0,5-2 | 0,1-1 |
Ингибитор РНКаз | 40 ЕД/мкл | 20 ЕД | 0,5 |
Матрица РНК | - | - | Используют от 0,1 нг до 5 мкг тотальной РНК; 1–500 нг поли(A) мРНК; 0,001–500 нг специфического транскрипта |
Ревертаза RevM | 200Ед/мкл** | 100Ед/реакция | 0,5 |
H2O, не содержащая нуклеаз | - | - | До 20мкл |
*
При использовании праймеров, специфичных для представляющего интерес гена, применяемая концентрация может составлять 10–20 пмоль/реакция. **
Концентрация ревертазы RevM может варьироваться в пределах 50–200 единиц на реакцию (объем: 20 мкл).Для большинства приложений подходящей начальной точкой является 100 Ед/реакция.
3. Тщательно перемешать реакционную смесь и внести соответствующие объемы в пробирки или планшеты для ПЦР.
4. Запрограммировать термоциклер в соответствии с программой, описанной в таблицах 2 и 3.
Таблица 2. Программа амплификации для случайного гексамерного праймера и праймера олиго(dT)18Этап цикла | Температура, °С | Время, мин |
Синтез | 50–55 | 15–60 |
Инактивация | 75 | 5 |
Хранение | 4 | ∞ |
Таблица 3. Программа амплификации для ген-специфического праймераЭтап цикла | Температура, °С | Время, мин |
Синтез | 50–55 | 60 |
Инактивация | 75 | 5 |
Хранение | 4 | ∞ |
Для последующего анализа кДНК методом ПЦР рекомендуется использовать не более 2 мкл полученного образца на реакцию амплификации объемом 25 мкл.
Для ПЦР с химической детекцией зонда рекомендуется использовать мастер-микс 5Х Fast Probe qPCR U (#M5-FPU, БелБиолаб). Для обнаружения с помощью интеркалирующего красителя, входящего в готовую ПЦР-смесь 5X Fast Dye U (#M5-FDU, БелБиолаб).
Образец кДНК можно хранить не менее месяца при температуре –20 °C.
Более длительное хранение осуществляется при температуре –70 °C.
УСЛОВИЯ ХРАНЕНИЯ И ТРАНСПОРТИРОВКИ• От –24 до –16 °С: 2 года.
• От +2 до +8 °C: 3 месяца.
• Не выше +25 °С: 14 суток.
Только для исследовательской работы. Товар не предназначен для медицинских целей!ФАСОВКИКод с артикулом | Компоненты продукта | Количество, мкл |
RFSK-M-50
| Ревертаза RevM (200 е.а./мкл) | 60 |
РНАзин М (40 е.а./мкл) | 30 |
5X реакционный буфер TG+ | 250 |
Праймеры oligo(dT)18 (100 пмоль/мкл) | 60 |
Смесь случайных гексамерных праймеров (100 пмоль/мкл) | 60 |
Вода, свободная от нуклеаз | 3x1250 |
RFSK-M-100
| Ревертаза RevM (200 е.а./мкл) | 120 |
РНАзин М (40 е.а./мкл) | 60 |
5X реакционный буфер TG+ | 500 |
Праймеры oligo(dT)18 (100 пмоль/мкл) | 120 |
Смесь случайных гексамерных праймеров (100 пмоль/мкл) | 120 |
Вода, свободная от нуклеаз | 5x1250 |
СмотретьСкачать