ОПИСАНИЕ ПРОДУКТА Мастер-микс для ПЦР 2X Fast Dye U готовая к использованию смесь для полимеразной цепной реакции с интеркалирующим красителем и детекцией в режиме реального времени. Мастер-микс содержит вещества, которые увеличивают время работы и процессивность ДНК-полимеразы Тад за счет повышения ее стабильности во время ПЦР. Наличие dUTP в реакционной смеси приводит к тому, что все продукты амплификации будут содержать в своем составе урацил. При этом UDG эффективно гидролизует урацил (апуринизация) из одно- и двухцепочечных молекул ДНК во время постановки реакции, предотвращая, таким образом, амплификацию продуктов предшествующих ПЦР (ампликонов), что позволяет избежать получения ложноположительных результатов. UDG инактивируется во время первого цикла денатурации ДНК и не препятствует амплификации продуктов текущей реакции. Мастер-микс для ПЦР 2X Fast Dye U содержит ДНК-полимеразу Тад, которая инактивирована антителами и не проявляет ферментативной активности во время приготовления реакционной смеси. Это приводит к повышению специфичности и чувствительности реакции. Активация фермента происходит во время первого цикла денатурации ДНК. В некоторых комплектациях мастер-микс может содержать референсный краситель ROX (в зависимости от прибора для количественной ПЦР конечная концентрация составляет 0,5 мкМ (High ROX) или 0,03 мкМ (Low ROX)).
УСЛОВИЯ ХРАНЕНИЯ И ТРАНСПОРТИРОВКИ От -24 до -16°C 1 год. • От +2 до +8°C 14 суток. • Допустимое число циклов замораживания/размораживания: 10
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ ПЦР с интеркалирующим красителем
СТАНДАРТНЫЙ ПРОТОКОЛ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ПРОДУКТАПеред началом анализа важно учесть следующее:
- При использовании зондов наибольшая эффективность ПЦР с детекцией результатов в режиме реального времени наблюдается при длине мишени 70-200 п.н.
- Мастер-микс оптимизирован для конечного объема реакционной смеси 20 мкл. Если используются другие объемы реакционной смеси, необходимо скорректировать количество мастер-микса для ПЦР 2X Fast Dye U (см. таблицу 1).
- Для обеспечения наилучших результатов рекомендуется анализировать каждый стандартный или испытуемый образец ДНК в трех повторах.
- Проводят ПЦР в соответствии с параметрами, указанными в таблице 2.
Таблица 1. Схема ПЦР с использованием интеркалирующего красителя и детекцией результатов в режиме реального времени
Компонент | Объем/20 мкл реакционной смеси | Конечная концентрация |
Мастер-микс для ПЦР 2X Fast Dye U | 10 мкл | 1x |
Прямой праймер (переменный) | - | 0,1-0,5 мкМ |
Обратный праймер (переменный) | - | 0,1-0,5 мкМ |
Матричная ДНК | - | От 10 нг до 50 нг* |
H2O, не содержащая нуклеаз | В количестве, необходимом для доведения объема до 20 мкл
|
*рекомендуемые концентрации для геномной ДНК человека Таблица 2. Рекомендуемые условия амплификации для ПЦР с использованием интеркалирующего красителя и детекцией результатов в режиме реального времени
Этап цикла | Температура, °C | Время | Количество циклов |
Начальная денатурация | 95 | 2 мин | 1 |
Денатурация | 95 | 10 c |
35-45
|
Отжиг* | 55-65** | 15 c |
Элонгация | 72 | 15 c |
Кривая плавления* | 65-95 | 0,2-0,5°C/c | 1 |
*
Сбор данных FAM/EVA/SybrGreen. **
Температура отжига зависит от температуры плавления (Tm) праймеров. Обычно подходящие значения температуры отжига примерно на 2-5°C ниже, чем Тт праймеров. Рекомендуется применять температурный градиент. СмотретьСкачать