Описание продукта
2X Blitz MasterMix представляет собой готовую смесь для проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР) с повышенной точностью синтеза ДНК.
В состав 2X Blitz MasterMix входят все необходимые компоненты:
- Термостабильная ДНК-полимераза
- Оптимизированный буфер
- дНТФ
- MgCl_2
ДНК-полимераза, входящая в состав 2X Blitz MasterMix — термостабильный фьюжн Pfu ДНК-полимеразы и ДНК-связывающего домена белка SSo7d.
ДНК-связывающий домен стабилизирует комплекс ДНК-полимеразы с матрицей, что приводит к повышению процессивности, скорости синтеза, точности и устойчивости фермента к высокой ионной силе раствора. Кроме того, Blitz ДНК-полимераза устойчива к ингибиторам и может быть использована в «прямой» ПЦР без предварительной очистки матрицы (устойчива к 10% крови). Фермент не ингибируется дУТФ.
2X Blitz MasterMix катализирует синтез ДНК в направлении от 5'- к 3'-концу растущей цепи; обладает корректирующей 3'-5'-экзонуклеазной активностью; не имеет 5'-3'-экзонуклеазной активности (не подходит TaqMan-дизайн зондов, подходит LUX, Sandwich-дизайн зондов или интерколирующие красители).
2X Blitz MasterMix обладает повышенной скоростью синтеза ДНК (до 4 000 п.о./мин) и способен амплифицировать фрагменты длинной более 40 000 п.о.
Область применения:
- Высокоточная ПЦР
- Амплификация длинных фрагментов
- «Прямая» ПЦР (без предварительной очистки матрицы)
- Подготовка библиотек ДНК в методах секвенирования нового поколения (NGS)
ВНИМАНИЕ! Blitz ДНК-полимераза не обладает горячим стартом, мы рекомендуем подготовить мастермикс на льду. Для уменьшения ошибки пипетирования при постановке нескольких параллельных реакций рекомендуется приготовить общий ПЦР-премикс. Объем ПЦР-премикса рассчитывается исходя из числа реакций с добавлением одного дополнительного образца. После того, как аликвоты ПЦР-премикса будут внесены в предварительно промаркированные ПЦР-пробирки, в них добавляют соответствующую ДНК-матрицу.
Стандартный протокол использования
- Перед использованием разморозить и тщательно перемешать все компоненты мастермикса путем переворачивания пробирки. Не вортексировать.
- Приготовить реакционную смесь согласно таблице 1. Количество вносимых компонентов приведено для одной реакции объемом 50 мкл.
Таблица 1. Состав реакционной смеси для ПЦР амплификации длинных фрагментов (50 мкл)Компонент | Объем, мкл | Конечная концентрация |
2X Blitz Mastermix* | 25 | 1-кратный |
Прямой праймер, 50 мкМ | 1 – 2 | 0,2 – 0,4 мкМ |
Обратный праймер, 50 мкМ | 1 – 2 | 0,2 – 0,4 мкМ |
ДНК-матрица | Определяет пользователь | 10 – 100 нг |
H_2O (свободная от нуклеаз) | Довести объем реакционной смеси до 50 мкл
|
*2X Blitz Mastermix содержит ацетат магния (в конечной концентрации 3 мМ) и dNTP (в конечной концентрации 0,2 мМ).В зависимости от особенностей используемой ДНК-матрицы и задач исследования, состав реакционной смеси может быть оптимизирован:
- оптимальная концентрация праймеров может находиться в диапазоне 0,05–1 мкМ;
- на одну реакцию объемом 50 мкл рекомендуется использовать 1 пг – 10 нг плазмидной, фаговой или бактериальной ДНК; 1–100 нг геномной эукариотической ДНК;
Допускается использование праймеров с другой начальной концентрацией. Рекомендуемый объем ПЦР-смеси для одной реакции — 50 мкл.
Рекомендуемые условия амплификацииТаблица 2а. Рекомендуемые условия амплификации для рутинной ПЦРЭтап | Температура, °C | Время, сек | Кол-во циклов |
Начальная денатурация | 98 | 30 | 1 |
Денатурация | 98 | 5 | 40 – 50 |
Отжиг праймеров | 60 – 72* | 15
|
Элонгация | 72 | 20
|
Таблица 2б. Рекомендуемые условия амплификации для рутинной ПЦР (для библиотек/длинных фрагментов)Этап | Температура, °C | Время, сек | Кол-во циклов |
Начальная денатурация | 98 | 30 | 1 |
Денатурация | 98 | 5 | 25 |
Отжиг праймеров | 60 – 72* | 15
|
Элонгация | 72 | + 20 сек на каждую 1000 п.о.**
|
*2X Blitz Mastermix содержит ацетат магния (в конечной концентрации 3 мМ) и dNTP (в конечной концентрации 0,2 мМ).В зависимости от особенностей используемой ДНК-матрицы и задач исследования, состав реакционной смеси может быть оптимизирован:
- оптимальная концентрация праймеров может находиться в диапазоне 0,05–1 мкМ;
- на одну реакцию объемом 50 мкл рекомендуется использовать 1 пг – 10 нг плазмидной, фаговой или бактериальной ДНК; 1–100 нг геномной эукариотической ДНК;
Допускается использование праймеров с другой начальной концентрацией. Рекомендуемый объем ПЦР-смеси для одной реакции — 50 мкл.
Рекомендуемые условия амплификацииТаблица 2а. Рекомендуемые условия амплификации для рутинной ПЦРЭтап | Температура, °C | Время, сек | Кол-во циклов |
Начальная денатурация | 98 | 30 | 1 |
Денатурация | 98 | 5 | 40 – 50 |
Отжиг праймеров | 60 – 72* | 15
|
Элонгация | 72 | 20
|
Таблица 2б. Рекомендуемые условия амплификации для рутинной ПЦР (для библиотек/длинных фрагментов)Этап | Температура, °C | Время, сек | Кол-во циклов |
Начальная денатурация | 98 | 30 | 1 |
Денатурация | 98 | 5 | 25 |
Отжиг праймеров | 60 – 72* | 15
|
Элонгация | 72 | + 20 сек на каждую 1000 п.о.**
|
* — в зависимости от температуры плавления праймеров; — При амплификации библиотек время элонгации подбирается эмпирически.Дополнительная информация
Буфер для хранения и разведения: 20 мМ Трис-HCl (pH 8,0); 100 мМ KCl; 0,5 мМ ЭДТА; 50 % глицерин; 0,5 % Tween-20
УСЛОВИЯ ХРАНЕНИЯ И ТРАНСПОРТИРОВКИ- Транспортировка допускается до 14 дней при температуре не выше +2°C – +8°C.
- Срок годности при соблюдении условий хранения: год с даты производства при температуре от -24°C до -16°C.
- Допускается заморозка/оттаивание 2X Blitz MasterMix не более 10 раз.
СмотретьСкачать