ОПИСАНИЕ ПРОДУКТАДНК-полимераза TaqA представляет собой смесь высокоочищенной рекомбинантной ДНКполимеразы Taq (Thermophilus aquaticus) и специфического низкомолекулярного ингибитора активности.
ДНК-полимераза TaqA не обладает ферментативной активностью в условиях приготовления ПЦР-смеси, что приводит к повышению специфичности и чувствительности реакции. Ингибирование ДНК-полимеразы сохраняется при инкубировании с субстратом в течение 1 ч при 37 оС. При этом активация фермента происходит в процессе первого цикла денатурации ДНК.
ДНК-полимераза TaqA катализирует синтез ДНК в направлении от 5’- к 3’-концу растущей цепи; не обладает детектируемой корректирующей 3’-5’-экзонуклеазной активностью; имеет 5’-3’-экзонуклеазную активность.
ДНК-полимераза TaqA обеспечивает высокий выход ПЦР-продукта при использовании различных ДНК-матриц, наличие Hot-старт инактивации полимеразы снижает риск неспецифических продуктов.
ДНК-полимераза TaqA может поставляться в комплекте с 10-кратным буфером, состав которого оптимизирован для амплификации ДНК в стандартных условиях, а также раствором 50мМ MgCl2.
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ• Мультиплексная ПЦР (рекомендуется использовать готовые смеси БелБиоЛаб для получения оптимального результата, например, из линеек Fast Probe или One-Step);
• Рутинная ПЦР (рекомендуем, ПЦР-смесь для нанесения на агарозный гель-paR-BA);
• Высокоспецифичная ПЦР (рекомендуется использовать готовые смеси БелБиоЛаб для получения оптимального результата, например, с полимеразой Blitz);
• ПЦР с интеркалирующими красителями (рекомендуем, M2-FDU-0.5);
СТАНДАРТНЫЙ ПРОТОКОЛ ИСПОЛЬЗОВАНИЯРекомендуется приготовить общий ПЦР-премикс, содержащий все компоненты смеси (воду, дНТФ, буфер, ДНК-полимеразу, праймеры). Объем ПЦР-премикса рассчитывается исходя из числа реакций с запасом на ошибки пипетирования. После того, как аликвоты ПЦР-премикса будут внесены в предварительно промаркированные ПЦР-пробирки (рекомендуем пластик для ПЦР Omnitip и AHN).
1. Перед использованием разморозить и тщательно перемешать все компоненты ПЦР-смеси.
2. Приготовьте реакционную смесь согласно Таблице 1 (для рутинной ПЦР) и Таблице 2 (для ПЦР с двумеченными зондами).
3. Количество вносимых компонентов приведено для одной реакции объемом 25 мкл.
Таблица 1. Состав реакционной смеси (для рутинной ПЦР) (25 мкл)Компонент | Объем, мкл | Конеч. конц. |
10Х буфер А | 2,5 | 1-кратный |
дНТФ, 10 мМ | 0,5 | 200 мкМ |
MgCl2 , 50 мM | 0,75 – 1,25 | 1,5 – 2,5 мМ |
Прямой праймер, 10 мкМ | 0,5 - 1 | 0,2 - 0,4 мкМ |
Обратный праймер, 10 мкМ | 0,5 - 1 | 0,2 - 0,4 мкМ |
ДНК-матрица | Определяется пользователем | 100 - 250 нг/ на реакцию |
TaqА (5 ед/мкл) | 0,2 – 0,3 | 0,5 – 2 ед/ на реакцию |
H2O (свободная от нуклеаз) |
Довести объем реакционной смеси до 25 мкл |
Таблица 2. Состав реакционной смеси (для ПЦР с двумеченными зондами) (25 мкл)Компонент | Объем, мкл | Конеч. конц. | Входит в состав / требуется заказ |
10Х буфер A | 2,5 | 1-кратный | входит |
дНТФ, 10 мМ | 0,5 | 200 мкМ | R-M10-5 |
MgCl2 , 50 мM | 2 | 4 мМ | входит |
Прямой праймер, 10 мкМ | 0,5 - 1 | 0,2 - 0,4 мкМ | Не входит |
Обратный праймер, 10 мкМ | 0,5 - 1 | 0,2 - 0,4 мкМ | Не входит |
Зонд, 10 мкМ | 0,25 – 0,7 | 0,1 – 0,28 мкМ | Не входит |
ДНК-матрица | Определяется пользователем | 10 - 100нг/ на реакцию | Не входит |
TaqА (5 ед/мкл) | 0,4 – 0,6 | 2 - 3 ед/ на реакцию | входит |
H2O (свободная от нуклеаз) |
Довести объем реакционной смеси до 25 мкл | R-W1-50 |
4. Аккуратно перемешать реакционную смесь и осадить капли со стенок пробирки.
5. Провести ПЦР.
Рекомендуемые условия амплификации для анализа ПЦР-продуктов представлены в Таблице 3 (для рутинной ПЦР) и Таблице 4 (для ПЦР с двумеченными зондами).
Таблица 3. Программа амплификации (для рутинной ПЦР)Этап | Температура, oС | Время, сек | Кол-во циклов |
Начальная денатурация | 95 | 120 | 1 |
Денатурация | 95 | 15 |
25 - 40
|
Отжиг праймеров | 55–67* | 15 |
Элонгация | 72 | 60 сек. на каждую 1 000 п.о. ** |
Финальная элонгация | 72 | 300 | 1 |
Хранение | 4 | ∞ | 1 |
*
в зависимости от температуры плавления праймеров; **
длина амплифицируемого фрагмента не должна превышать 5 000 п.оТаблица 4. Программа амплификацииЭтап | Температура, oС | Время, сек | Кол-во циклов |
Начальная денатурация | 95 | 120 | 1 |
Денатурация | 95 | 5 |
40 - 50
|
Отжиг праймеров | 60* | 15 |
Элонгация** | 72 | 15 |
*
зависит от последовательности олигонуклеотидных праймеров и зонда **
стадия может быть опущена для сокращения времени реакцииУСЛОВИЯ ХРАНЕНИЯТранспортировка допускается до 7 дней при температуре не выше 25°С
Срок годности при соблюдении условий хранения при температуре от -24°С – -16°С – 1 года c даты производства
Буфер для хранения и разведения 20мМ Трис-HCl (pH 8,0); 100мМ KCl; 0,5мМ ЭДТА; 50% глицерин; 0,5% Tween-20
10Х буфер A 650mM Трис-HCl (pH 8.8), 166mM (NH4)2SO4, 0,5% Tween-20
СмотретьСкачать