Состав набора:Компоненты | KFL-25 | KFL-25 | KFL-25 | Температура хранения |
Т4 ДНК лигаза | 28 мкл | 55 мкл | 165 мкл | -20°С |
Реакционный буфер | 140 мкл | 275 мкл | 825 мкл | -20°С |
Вода ультрачистая | 1.5 мл | 1.5 мл | 2х1.5 мл | от -20°С до +20°С |
Примечания:- Вектор для клонирования и вставка ДНК должны быть растворены в воде или буфере Tris (10 мМ Tris HCl, pH 8.0).
- В смеси для лигирования рекомендуется использовать стандартные количества вектора и вставки ДНК. Молярное соотношение клонирующего вектора к вставке ДНК должно составлять 1:3 (например, 0,020 пмоль вектора ДНК к 0,060 пмоль вставки ДНК).
- Лигазу не следует термически инактивировать. Термическая инактивация значительно снижает эффективность трансформации.
- Не рекомендуется увеличивать время лигирования более чем на 10 минут.
Протокол лигирования:1. Разморозьте все компоненты, поместите в лёд
2. Смешайте пипетированием все компоненты
3. Инкубируйте 5 минут при комнатной температуре (21°C - 23°C)
4. Держите на льду до трансформации или храните на -20°C.
Примечание. Для примера количество вектора и вставки (нг) приведено с вектором длиной 4 кб и вставкой длиной 1 кб.
Общий объем | 20 мкл |
Т4 ДНК лигаза | 1 мкл |
Буфер для быстрого лигирования | 5 мкл |
Вектор ДНК | 0.02 пмоль* |
Вставка ДНК | 0.06 пмоль* |
Вода ультрачистая | довести до конечного объема 20 мкл |
*Формула расчета концентрации ДНК
Для расчета количества пмоль каждого фрагмента на основе длины и массы фрагмента ДНК рекомендуется следующая формула:
пмоль = (масса в нг) x 1000 / (п.н. x 650 дальтон)
Длина фрагмента ДНК п.н. | Количество фрагмента ДНК 0,1 пмоль |
200 | 6,5 нг |
300 | 19,5 нг |
500 | 32,5 нг |
1000 | 65 нг |
2000 | 130 нг |
3000 | 195 нг |
4000 | 260 нг |
5000 | 325 нг |
Трансформация E. coliСмесь для реакции может быть непосредственно использована для трансформации компетентных клеток E. coli химическими методами или методом электропорации. Для трансформации рекомендуется использовать набор для трансформации.