ОПИСАНИЕ ПРОДУКТА5x Fast Probe qPCR Mastermix представляет собой готовую к использованию смесь для количественной и/или качественной ПЦР с детекцией результатов в режиме реального времени (далее ПЦР-РВ)
В состав 5X Fast Probe qPCR Mastermix входят следующие компоненты:
- термостабильная ДНК-полимераза TaqA с «горячим стартом» (#E-TAP-50, БелБиоЛаб)
- дНТФ
- Ацетат (конечная концентрация в реакционной смеси 5 мМ)
- оптимизированный буфер
Использование 5x Fast Probe qPCR Mastermix при проведении ПЦР-РВ обеспечивает получение воспроизводимых результатов с высокой чувствительностью (единичные копии ДНК) при определении количества геномной, плазмидной, вирусной ДНК.
В состав 5x Fast Probe qPCR Mastermix входит инактивированная ДНК-полимераза TaqA, которая не обладает ферментативной активностью в условиях приготовления ПЦРсмеси, что приводит к повышению специфичности и чувствительности реакции. Активация фермента происходит в процессе первого цикла денатурации ДНК при температуре выше 40 С.
5x Fast Probe qPCR Mastermix обеспечивает проведение мультиплексных ПЦР-РВ (до 4 одновременно-детектируемых мишеней). При постановке мультиплексных реакций рекомендуется оптимизация количества олигонуклеотидов и зонда для каждой мишени.
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ- Мультиплекс ПЦР-РВ
- Рутинная ПЦР
- Низкокопийная ПЦР
- ПЦР-РВ с Taqman-дизайном зондов
СТАНДАРТНЫЙ ПРОТОКОЛ ИСПОЛЬЗОВАНИЯДля уменьшения ошибки пипетирования при постановке нескольких параллельных реакций рекомендуется приготовить общий ПЦР-премикс, содержащий все компоненты смеси (зонд, воду, 5x Fast Probe qPCR Mastermix и праймеры) за исключением ДНКматрицы. Объем ПЦР-премикса рассчитывается исходя из числа реакций с запасом на одну пробу. После того, как аликвоты ПЦР-премикса будут внесены в предварительно промаркированные ПЦР-пробирки, в них добавляют соответствующую ДНК-матрицу.
- Перед использованием разморозить и перемешать все компоненты ПЦР-смеси
- Приготовить реакционную смесь согласно таблице 1. Количество вносимых компонентов приведено для одной реакции объемом 25 мкл.
Таблица 1. Состав реакционной смеси для ПЦР амплификации длинных фрагментов (25 мкл)Компонент | Объём, мкл | Конечная концентрация |
5X Fast-probe qPCR Mastermix | 5
| 1-кратный |
Прямой праймер, 10 мкМ | 0,5-1
| 0,2 – 0,4 мкМ |
Обратный праймер, 10 мкМ | 0,5-1
| 0,2 – 0,4 мкМ |
Зонд, 10 мкм | 0,25-0,7
| 0,1 – 0,28 мкМ |
ДНК-матрица | Определяет пользователь
| 0,1 – 250 нг |
Н2О свободная от нуклеаз | Довести объем реакционной смеси до 25 мкл.
|
В зависимости от особенностей используемой ДНК-матрицы и задач исследования, состав реакционной смеси может быть оптимизирован:
- оптимальная концентрация праймеров может находиться в диапазоне 0,05–1 мкМ;
- на одну реакцию объемом 25 мкл рекомендуется использовать 1 пг – 10 нг плазмидной, фаговой или бактериальной ДНК; 0,1–100 нг геномной эукариотической ДНК.
Рекомендуется дополнительно включать в анализ NTC (no template control) – реакцию, содержащую все компоненты реакции кроме ДНК-матрицы.
Допускается использование праймеров и зондов с другой начальной концентрацией. Рекомендуемый объем ПЦР-смеси для одной реакции – 25 мкл. Однако при необходимости объем реакционной смеси может быть изменен с сохранением конечной концентрации входящих в нее компонентов.
3. Аккуратно перемешать реакционную смесь и осадить капли со стенок пробирки.
4. Провести ПЦР согласно таблице 2
Таблица 2. Рекомендуемые условия амплификации для ПЦР в «реальном времени» Этап | Температура, °C | Время, сек | Кол-во циклов |
Начальная денатурация | 95
| 120
| 1
|
Денатурация | 95
| 5
|
40-50
|
Отжиг праймеров | 60
| 15
|
Элонгация | 72 | 15 |
Буфер для хранения и разведения: 20 мм Трис-HCl ($pH8,0$); 100 мМ КСІ; 0,5 ММ ЭДТА; 50% глицерин; 0,5% Tween-20.
УСЛОВИЯ ХРАНЕНИЯ И ТРАНСПОРТИРОВКИ- Транспортировка допускается до 14 дней при температуре не выше 4-8°С
- Срок годности при соблюдении условий хранения: год с даты производства при температуре от -24°С до -16°С.
- Допускается заморозка/оттаивание 5X Fast-Probe qPCR Mastermix не более 10 раз.
- Рекомендуется приготовить аликвоты 5X Fast-Probe qPCR Mastermix Mastermix удобного объема для однократного использования.
Кат. номер
| Кол-во реакций | Кол-во реагента в пробирке |
M5-FP
| M5-FP-0.25 | 50 | 0,25 мл (1*0,25) |
M5-FP-0.5 | 500 | 2,5 мл (2*1,25) |
M5-FP-1 | 1 000 | 5 мл (4*1,25) |
M5-FP-5 | 5 000 | 25 мл (20*1,25) |
M5-FP-10 | 10 000 | 50 мл (1*50) |
M5-FP-50 | 50 000 | 250 мл (5*50) |
СмотретьСкачать