ОПИСАНИЕ ПРОДУКТА5X Fast Probe qPCR Mastermix U представляет собой готовую к использованию смесь для количественной и/или качественной ПЦР с детекцией результатов в режиме реального времени (далее ПЦР-РВ).
В состав 5X Fast Probe qPCR Mastermix U входят следующие компоненты:
- термостабильная ДНК-полимераза Тада с «горячим стартом» (#Е-ТАР-50, БелБиоЛаб); дНТФ, включая дУТФ;
- урацил-ДНК-гликозилаза (UDG);
- MgCl2 (конечная концентрация в реакционной смеси 5 мм); оптимизированный буфер.
Использование инактивированной ДНК-полимеразы, которая не обладает ферментативной активностью в условиях приготовления ПЦР-смеси, приводит к повышению специфичности и чувствительности реакции. Активация фермента происходит в процессе первого цикла денатурации ДНК. Наличие в реакционной смеси дУТФ приводит к тому, что все продукты амплификации будут содержать в своем составе урацил. При этом UDG эффективно гидролизует урацил из одно- и двухцепочечных молекул ДНК во время постановки реакции, предотвращая, таким образом, амплификацию продуктов предшествующих ПЦР и получение ложноположительных результатов. UDG полностью инактивируется в процессе первого цикла денатурации ДНК и не препятствует амплификации продуктов текущей реакции.
Использование 5X Fast Probe qPCR Mastermix при проведении ПЦР-РВ обеспечивает получение воспроизводимых результатов с высокой чувствительностью (единичные копии ДНК) при определении количества геномной, плазмидной, вирусной ДНК. 5X Fast Probe qPCR Mastermix U обеспечивает проведение мультиплексных ПЦР-РB (до 5 одновременно-детектируемых мишеней). При постановке мультиплексных реакций рекомендуется оптимизация количества олигонуклеотидов и зонда для каждой мишени.
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ- Мультиплекс ПЦР-РВ
- Рутинная ПЦР
- Низкокопийная ПЦР
- ПЦР-РВ с Тaqman-дизайном зондов
СТАНДАРТНЫЙ ПРОТОКОЛ ИСПОЛЬЗОВАНИЯДля уменьшения ошибки пипетирования при постановке нескольких параллельных реакций рекомендуется приготовить общий ПЦР-премикс, содержащий все компоненты смеси (воду, 5x Fast Probe qPCR U Mastermiх и праймеры) за исключением ДНК-матрицы. Объем ПЦР-премикса рассчитывается исходя из числа реакций с добавлением одного дополнительного образца. После того, как аликвоты ПЦР-премикса будут внесены в предварительно промаркированные ПЦР-пробирки, в них добавляют соответствующую ДНК-матрицу.
- Перед использованием разморозить и перемешать все компоненты ПЦР-смеси.
- Приготовить реакционную смесь согласно таблице 1. Количество вносимых компонентов приведено для одной реакции объемом 25 мкл.
Таблица 1. Состав реакционной смеси для ПЦР амплификации длинных фрагментов (50 мкл) (Примечание в источнике: в заголовке указано 50 мкл, в тексте и таблице — расчет на 25 мкл) Компонент | Объём, мкл | Конечная концентрация |
5X Fast-probe qPCR U Mastermix | 5 | 1-кратный |
Прямой праймер, 10 мкМ | 0,5-1 | 0,2-0,4 мкМ |
Обратный праймер, 10 мкМ | 05-1 | 0,2 - 0,4 мкМ |
Зонд, 10 мкМ | 0,25-0,7 | 0,1 - 0,28 мкМ |
ДНК-матрица | Определяет пользователь | 0,1-250 нг |
Н2О свободная от нуклеаз | Довести объем реакционной смеси до 25 мкл
|
В зависимости от особенностей используемой ДНК-матрицы и задач исследования, состав реакционной смеси может быть оптимизирован:
- оптимальная концентрация праймеров может находиться в диапазоне 0,05-1 мкм;
- на одну реакцию объемом 25 мкл рекомендуется использовать 1 пг 10 нг плазмидной, фаговой или бактериальной ДНК; 0,1-100 нг геномной эукариотической ДНК.
Рекомендуется дополнительно включать в анализ NTC (no template control) - pеакцию, содержащую все компоненты реакции кроме ДНК-матрицы. Допускается использование праймеров и зондов с другой начальной концентрацией. Рекомендуемый объем ПЦР-смеси для одной реакции 25 мкл. Однако при необходимости объем реакционной смеси может быть изменен с сохранением конечной концентрации входящих в нее компонентов.
- Аккуратно перемешать реакционную смесь и осадить капли со стенок пробирки.
- Провести ПЦР согласно таблице 2.
Таблица 2. Рекомендуемые условия амплификации для ПЦР в «реальном времени» Этап | Температура, °C | Время, сек | Кол-во циклов |
Начальная денатурация | 95 | 120 | 1 |
Денатурация | 95 | 5 |
|
Отжиг праймеров | 60 | 15 | 40-50 |
Элонгация | 72 | 15 |
|
Буфер для хранения и разведения: 20 мм Трис-HCl (pH 8,0); 100 мм КСІ; 0,5 ММ ЭДТА; 50% глицерин, 0,5% Tween-20
УСЛОВИЯ ХРАНЕНИЯ И ТРАНСПОРТИРОВКИ- Транспортировка допускается до 14 дней при температуре не выше 4-8°C.
- Срок годности при соблюдении условий хранения: год с даты производства при температуре от -24°C до -16°C.
- Допускается заморозка/оттаивание 5X Fast-Probe qPCR U Mastermix не более 10 раз.
- Рекомендуется приготовить аликвоты 5X Fast-Probe qPCR U Mastermix удобного объема для однократного использования.
ФАСОВКИ
Кат. номер | Кол-во реакций | Кол-во реагента в пробирке |
M5-FP- U
| M5-FP-0.25 | 50 | 0,25 мл (1*0,25) |
M5-FP-0.5 | 500 | 2,5 мл (2*1,25) |
M5-FP-1 | 1000 | 5 мл (41,25) |
M5-FP-5 | 5000 | 25 мл (201,25) |
M5-FP-10 | 10 000 | 50 мл (1*50) |
M5-FP-50 | 50 000 | 250 мл (5*50) |
СмотретьСкачать