ОПИСАНИЕ ПРОДУКТА5Х One-Step RT-PCR Mastermix представляет собой готовую к использованию смесь для получения кДНК с последующей количественной и/или качественной ПЦР с детекцией результатов в режиме реального времени (далее ОТ-ПЦР). При этом синтез кДНК и ПЦР осуществляется в одной пробирке.
Использование 5Х One-Step RT-PCR Mastermix для проведения ОТ-ПЦР обеспечивает получение воспроизводимых результатов с высокой чувствительностью (единичные копии РНК).
5Х One-Step RT-PCR Mastermix содержит все основные реагенты, включая ревертазу c «горячим стартом», термостабильную ДНК-полимеразу с «горячим стартом», дНТФ и оптимизированный буфер.
В состав 5Х One-Step RT-PCR Mastermix входит генетически модифицированная ревертаза MMLV (#E-RTH-50, БелБиоЛаб) с подавленной активностью РНКазы Н и повышенной термостабильностью, а также улучшенной эффективностью при использовании GC-богатых РНК-матриц, что приводит к увеличению выхода кДНК.
Кроме того, в состав 5Х One-Step RT-PCR Mastermix входит инактивированная антителами ДНК-полимераза (#TDP-50, БелБиоЛаб), которая не обладает ферментативной активностью в условиях приготовления реакционной смеси и ревертирования, что приводит к повышению специфичности и чувствительности реакции.
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ- Мультиплекс ОТ-ПЦР
- Рутинная ОТ-ПЦР
- Низкокопийная ОТ-ПЦР
- Высокоспецифичная ОТ-ПЦР
СТАНДАРТНЫЙ ПРОТОКОЛ ИСПОЛЬЗОВАНИЯДля уменьшения ошибки пипетирования при постановке нескольких параллельных реакций рекомендуется приготовить общий ПЦР-премикс, содержащий все компоненты смеси (5Х One-Step RT-PCR Mastermix, зонд, праймеры).
1. Перед использованием разморозить и тщательно перемешать все компоненты ПЦР-смеси.
2. Приготовить реакционную смесь согласно таблице 1. Количество вносимых компонентов приведено для одной реакции объемом 25 мкл.
Таблица 1. Состав реакционной смеси для ПЦР амплификации длинных фрагментов (25 мкл)Компонент | Объём, мкл | Конечная концентрация |
5X One-Step RT-PCR Mastermix | 5 | 1-кратный |
Прямой праймер, 50 мкМ | 0,5 – 1 | 0,2 – 0,4 мкМ |
Обратный праймер, 50 мкМ | 0,5 – 1 | 0,2 – 0,4 мкМ |
Зонд, 50 мкМ | 0,25 – 0,7 | 0,1 – 0,28 мкМ |
РНК-матрица | Определяет пользователь | < 500 нг РНК на реакцию |
H2O свободная от нуклеаз | Довести объем реакционной смеси до 25 мкл
|
В зависимости от особенностей используемой ДНК-матрицы и задач исследования, состав реакционной смеси может быть оптимизирован:
- оптимальная концентрация праймеров может находиться в диапазоне от 0,05 до 1мкМ;
- на одну реакцию объемом 25 мкл рекомендуется использовать 1 пг – 5 мкг тотальной РНК или 10 пг – 500 нг мРНК.
Рекомендуется дополнительно включать в анализ NTC (no template control) – реакцию, содержащую все компоненты реакции кроме РНК-матрицы. Допустимо приготовление реакционной смеси при комнатной температуре.
3. Аккуратно перемешать реакционную смесь и осадить капли со стенок пробирки.
4. Провести ОТ-ПЦР согласно таблице 2.
Таблица 2. Рекомендуемые условия амплификации для ПЦР в «реальном времени»Этап | Температура, °С | Время | Кол-во циклов |
Ревертирование* | 55 | 10 мин.* | 1 |
Начальная денатурация | 95 | 2 мин. | 1 |
Денатурация | 95 | 5 сек. | 40-50
|
Отжиг праймеров/ Считывание сигнала** | 60 | 15 сек |
Элонгация | 72 | 15 сек |
|
*
– 10 минут ревертирования обеспечивают линейность детекции моноплексной мишени в пределах 101 – 109 копий на реакцию. При проведении мультиплесной детекции время ревертирования может быть увеличено до 30 минут;УСЛОВИЯ ХРАНЕНИЯ И ТРАНСПОРТИРОВКИХранить при температуре от -24°С до -16°С.
Транспортировка допускается при температуре от +2°С до +8°С в течении 7 дней.
Срок годности при соблюдении условий хранения – 1 год c даты производства.
Допускается заморозка/оттаивание 5Х One-Step RT-PCR Mastermix не более 10 раз.
Рекомендуется приготовить аликвоты 5Х One-Step RT-PCR Mastermix удобного объема для однократного использования
ФАСОВКИ
Кат. номер | Кол-во реакций | Кол-во реагента в пробирке |
M5-OS
| M5-OSP-0.1 | 100 | 0,5 мл |
M5-OSP-0.25 | 250 | 1,25 мл |
M5-OSP-0.5 | 500 | 2,5 мл (2*1,25) |
M5-OSP-1 | 1 000 | 5 мл (4*1,25) |
M5-OSP-5 | 5 000 | 20*1,25 мл (20*1,25) |
M5-OSP-10 | 10 000 | 50 мл (1*50) |
СмотретьСкачать